Akcja toczy się w rzymskim Egipcie, gdzie ukrywa się rodzina rzemieślników. Głównym bohaterem jest Chłopiec (Noah Jupe), który zmaga się z budzącymi się w nim niewytłumaczalnymi i przerażającymi mocami. Jego ojciec, Cieśla (Nicolas Cage), próbuje za wszelką cenę chronić syna przed światem zewnętrznym i przed nim samym, widząc w jego zdolnościach nie błogosławieństwo, lecz zagrożenie.

Gdy Chłopiec, pod wpływem buntu i ciekawości, zaczyna używać swoich darów, ściąga na rodzinę uwagę mrocznych sił i lokalnej społeczności pogrążonej w zabobonach. Spokojne życie zamienia się w koszmar pełen wizji, krwi i przemocy. Film jest interpretacją apokryficznej 'Ewangelii Dzieciństwa Tomasza', ukazaną w formie surowego survival horroru, w którym granica między boskością a diabolizmem zostaje całkowicie zatarta.